Les titulaires de chaire d'excellence en recherche du Canada sont sélectionnées à l'issue d'un processus en deux étapes très concurrentiel :
Les propositions sont soumises à un processus d’évaluation par les pairs à plusieurs niveaux. Ce processus comprend une évaluation menée par des experts externes et par un comité d’évaluation ainsi qu’une évaluation stratégique menée par le comité de sélection. Les propositions sont ensuite soumises à l’approbation finale du comité directeur.